Zapytanie ofertowe na wykonanie usługi "Przeprowadzenia monitoringu występowania żółwia błotnego na podstawie analizy DNA środowiskowego "
Postępowanie, o wartości szacunkowej poniżej 30 000 EURO, prowadzone jest w ramach realizacji projektu „Active protection of the rare amphibian and reptile species on the Natura 2000 sites in Europe” LIFE17 NAT/PL000011, finansowanego ze środków Unii Europejskiej, Narodowego Funduszu Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej oraz Wojewódzkiego Funduszu Ochrony Środowiska i Gospodarki Wodnej w Olsztynie.
I. NAZWA I ADRES ZAMAWIAJĄCEGO:
Park Krajobrazowy Puszczy Rominckiej
Żytkiejmy, ul. Szkolna 1
19-504 Dubeninki
adres strony internetowej Zamawiającego: www.pkwim.pl
II. TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA:
Postępowanie prowadzone jest zgodnie z Regulaminem udzielania zamówień publicznych, których wartość nie przekracza progu stosowania ustawy Prawo zamówień publicznych wprowadzonym Zarządzeniem Dyrektora PKPR nr 6/2014 z dnia 30 czerwca 2014 roku.
III. OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA
1.Przedmiotem zamówienia jest weryfikacja występowania żółwia błotnego (Emys orbicularis orbicularis) z wykorzystaniem analizy DNA środowiskowego (ang. eDNA) metodą qPCR.
Zamówienie obejmuje dwa zadania:
Zadanie 1. Przefiltrowanie 50 próbek wody o objętości 250 ml. i zabezpieczenie materiału biologicznego.
Zadanie 2. Analiza laboratoryjna obecności DNA żółwia błotnego metodą qPCR przedstawioną w opisie przedmiotu zamówienia - 50 próbek - analizy qPCR w pięciu powtórzeniach.
Z wykonanych prac Wykonawca sporządzi sprawozdanie w ilości 2 egzemplarzy w formie maszynopisu i w formie elektronicznej, które obejmować będzie wykaz i opis wykonanych prac zwierających m.in. lokalizację zbiorników z których pobrano próby, krótki opis obiektów z których pobrano próby, wyniki analiz laboratoryjnych w formie raportu, podsumowanie wyników badań.
Sprawozdanie musi zawierać również część graficzną (mapy lub kopie map z naniesioną lokalizacją punktów poboru prób i dokumentację fotograficzną z realizacji zadania obejmującą m.in. zbiorniki wodne (lub ich części) z których pobrano próby wody do badań.
Wszelkie koszty związane z wykonaniem ww. prac, w tym koszty transportu, pokrywa wykonawca.
Opis przeprowadzenia procedury monitoringu występowania żółwia błotnego na podstawie analizy DNA środowiskowego:
Procedura monitoringu żółwia błotnego składa się z dwóch zasadniczych etapów: przygotowanie próbek do analizy genetycznej oraz analizy na obecności DNA badanego gatunku metodą qPCR.
- Przygotowanie próbek do analizy genetycznej
Próbki w objętości 250 ml wody przekazane przez eksperta herpetologa w ciągu 24 godzin od dostarczenia muszą być przefiltrowane. Próbki wody mogą być przekazywane sukcesywnie w okresie od 20 marca do 10 maja. Przekazanie próbek wody odbywać się będzie w miejscu i czasie wskazanym przez specjalistę herpetologa.
Materiał biologiczny do badań DNA należy pozyskać z próbek wody poprzez filtrację metodą próżniową (filtracja za pomocą kolumny filtracyjnej i pompy próżniowej). Należy zastosować filtry membranowe MF-Millipore™ z mieszanego estru celulozy - 47 mm – 0,45µm. Przy każdorazowej filtracji cała kolumna filtracyjna musi być wysterylizowana. Materiał genetyczny w uzyskanych filtratach będzie niezwłocznie konserwowany poprzez mrożenie filtratów (filtrów membranowych) w sterylnym pojemniku w temperaturze ok. -20oC. Zabezpieczone próbki zostaną następnie przewiezione do laboratorium w celu przeprowadzenie analiz DNA.
- Opis metodologii laboratoryjnych analiz DNA środowiskowego (metoda qPCR)
Procedura analiz molekularnych obejmować będzie następujące etapy:
a) Ekstrakcja DNA genomowego komercyjnym zestawem do izolacji DNA z próbek środowiskowych o śladowej zawartości materiału genetycznego z wykorzystaniem syntetycznego DNA do monitorowania skuteczności ekstrakcji i obecności inhibitorów reakcji PCR (kontrola ekstracji DNA umożliwia walidację etapu).
b) Analiza qPCR przeprowadzona z wykorzystaniem starterów reakcji PCR i sondy TaqMan specyficznych dla analizowanego gatunku (sekwencja sondy przetestowana in silico pod kątem specyficzności względem badanego gatunku oraz braku komplementarności
w odniesieniu do gatunków zasiedlających ten sam biotop co żółw błotny). Para starterów
i sonda TaqMan zaprojektowane na podstawie analizy sekwencji genu cytb dla żółwia błotnego dostępnych w bazie GenBank ze szczególnym uwzględnieniem linii ewolucyjnych zidentyfikowanych na terenach objętych badaniem.
Analiza qPCR próbek środowiskowych prowadzona w pięciu powtórzeniach w obecności NTC (No Template Control) tzw. kontrola czystości i PTC.
c) Analiza pod kątem występowania DNA w zbadanych próbkach.
Wyniki analiz powinny być zestawione w formie raportu. Raport powinien zawierać tabelaryczne zestawienie wyników, w tym również wyników dla poszczególnych powtórzeń, PTC i NTC dla każdej analizowanej próby.
- Termin wykonania zamówienia.
- Przygotowanie próbek wody do analizy genetycznej od dnia podpisania Umowy do 10 maja 2019 r.
- Analizy genetyczne i opracowanie wyników i złożenie sprawozdania do zamawiającego do dnia 30 listopada 2019 roku.
- Wynagrodzenie za przedmiot umowy będzie wypłacone Wykonawcy w przeciągu 30 dni od daty akceptacji sprawozdania i przedłożenia prawidłowo wystawionej faktury bądź rachunku.
- Faktura (lub rachunek) wystawiona będzie na:
Nabywca: Województwo Warmińsko-Mazurskie
ul. Emilii Plater 1
10-562 Olsztyn
NIP: 7393890447
Odbiorca: Park Krajobrazowy Puszczy Rominckiej
IV. WARUNKI UDZIAŁU W POSTĘPOWANIU ORAZ OPIS SPOSOBU OCENY ICH SPEŁNIANIA
O udzielenie zamówienia mogą ubiegać się wykonawcy, którzy spełniają następujące warunki:
1. Dysponują minimum jedną osobą, która ukończyła studia drugiego stopnia lub jednolite studia magisterskie na kierunku biologia oraz posiada doświadczenie w badaniach genetycznych zwierząt.
2. Dysponują minimum jedną osobą, która ukończyła studia drugiego stopnia lub jednolite studia magisterskie na kierunku biologia oraz posiada doświadczenie w realizacji czynnej ochrony żółwia błotnego.
Wykonawca może polegać na wiedzy i doświadczeniu, potencjale technicznym lub osobach zdolnych do wykonania zamówienia innych podmiotów, niezależnie od charakteru prawnego łączących go z nimi stosunków. Wykonawca w takiej sytuacji zobowiązany jest udowodnić Zamawiającemu, iż będzie dysponował zasobami niezbędnymi do realizacji zamówienia, w szczególności przedstawiając w tym celu pisemne zobowiązanie do oddania mu do dyspozycji niezbędnych zasobów na okres korzystania z nich przy wykonywaniu zamówienia.
Ocena spełniania warunków udziału w postępowaniu przeprowadzona zostanie poprzez analizę i ocenę dokumentów, o których mowa w rozdziale V, potwierdzających spełnienie warunków, o których mowa w rozdziale IV. Brak jakiegokolwiek z niżej wykazanych dokumentów (oświadczeń) żądanych przez Zamawiającego, stanowić będzie podstawę do wykluczenia Wykonawcy z ubiegania się o udzielenie zamówienia publicznego, bądź do odrzucenia oferty. Ocena spełniania wymaganych warunków udziału w postępowaniu zostanie dokonana wg formuły: „spełnia - nie spełnia”.
V. OPIS SPOSOBU PRZYGOTOWYWANIA OFERT
1. Wykonawca może złożyć tylko jedną ofertę.
2. Wykonawca sporządzi ofertę według wzoru formularza oferty stanowiącego Załącznik nr 1 do niniejszego Zaproszenia.
3. Wymagane dokumenty potwierdzające, że wykonawca posiada (dysponuje) potencjałem zdolnym do wykonania zamówienia
- wykaz osób zdolnych do wykonania zamówienia, według wzoru stanowiącego Załącznik nr 2 do niniejszego Zaproszenia;
- oświadczenie o doświadczeniu osób, którymi dysponuje Wykonawca wg wzoru stanowiącego Załącznik nr 3 do niniejszego Zaproszenia;
4. Osobą do kontaktów jest Jaromir Krajewski - kom. 695198511.
VI. MIEJSCE ORAZ TERMIN SKŁADANIA OFERT
1. Oferty należy składać pocztą (Park Krajobrazowy Puszczy Rominckiej) lub mailem (rominten@onet.pl), do 18.03.2019 r. do godz. 12:00 (decyduje data i godzina dotarcia oferty do Zamawiającego).
VII. OPIS SPOSOBU OBLICZENIA CENY
1. Cenę (brutto) należy podać w PLN, z dokładnością do dwóch miejsc po przecinku. Podana cena jest obowiązująca w czasie trwania całej umowy.
2. Niedoszacowanie, pominięcie oraz brak rozpoznania zakresu przedmiotu umowy nie może być podstawą do żądania zmiany wynagrodzenia. Cena oferty brutto jest ceną ostateczną obejmującą wszystkie koszty i składniki związane z realizacją przedmiotu zamówienia.
VIII. OPIS KRYTERIÓW, KTÓRYMI ZAMAWIAJĄCY BĘDZIE SIĘ KIEROWAŁ PRZY WYBORZE OFERTY, WRAZ Z PODANIEM ZNACZENIA TYCH KRYTERIÓW I SPOSOBU OCENY OFERT
Zamawiający będzie oceniał oferty według następujących kryteriów:
Cena (koszt) - 100%
IX. WARUNKI OGÓLNE
1. Zamawiający zastrzega sobie prawo unieważnienia postępowania bez podania przyczyn takiej decyzji.
2. Zamawiający zastrzega, że oferta będzie stanowić informację publiczną.
X. ZAŁĄCZNIKI
- Formularz oferty
- Wzór wykazu osób
- Wzór oświadczenia o doświadczeniu osób, którymi dysponuje Wykonawca
- Projekt umowy